研究人员已经发现，CRISPR/Cas9的脱靶效应通常与sgRNA相关。除了针对特定的靶向位点外，sgRNA还可能容忍多达5至6个错配碱基，或者在缺少或额外增加碱基的基因组位置发生非靶向切割，从而产生脱靶效应。基因组中存在成千上万个潜在的脱靶位点，这使得全面评估全基因组范围内的脱靶效应成为一大挑战。

为此，88858cc永利官网推出了一种基于全基因组测序和生物信息学预测的方法，旨在分析脱靶效应导致的单核苷酸突变（SNV）、插入缺失变异（Indels）、拷贝数变异（CNV）和结构变异（SV）。近年来，基因组测序在脱靶检测中的应用日益广泛。Kevin等研究人员在2021年利用全基因组测序和生物信息学分析评估了Cas9的脱靶风险。他们对163个sgRNA在基因编辑小鼠与对照小鼠中进行了基因组序列和结构变异的比较，进而利用Cas-OFFinder工具预测了这163个sgRNA在基因组中的556,266个潜在脱靶位点。通过对变异信息和潜在脱靶位点的交集分析，研究团队成功检测到28个脱靶位点，其中9个经过Sanger测序验证为真实的脱靶位点。这项研究表明，尽管真实脱靶仅占潜在脱靶的很小一部分，但风险依然存在且不可忽视。

基于基因编辑的脱靶特性，88858cc永利官网结合基因组测序技术推出了全基因组脱靶检测服务。我们采用mutect2作为变异分析工具，通过比对基因编辑组和对照组的测序数据，鉴定基因编辑组的SNV和Indels变异。此外，使用Cas-OFFinder预测潜在脱靶位点，它能够分析sgRNA与基因组之间的匹配情况，为研究人员提供可能的脱靶位点信息。结合mutect2的变异分析结果和Cas-OFFinder的预测信息，我们能够有效识别发生的脱靶位点。

除了脱靶效应的深入分析外，我们还使用CNVkit和Manta两种生物信息学工具进行全面评估。CNVkit能够识别基因组中的拷贝数变化，而Manta则用于检测插入、缺失和易位等染色体结构变异类型。这些结果为了解基因编辑所引发的染色体结构变化提供了重要信息。

与传统的GUIDE-seq体内检测方法相比，88858cc永利官网的全基因组脱靶检测不依赖于ODN插入，提供了更为灵活和便捷的检测手段。同时，这种方法能够分析染色体大片段的变异，为用户全面评估基因编辑效果和潜在风险提供支持。作为国内首家提供脱靶检测服务的公司，88858cc永利官网提供包括全基因组脱靶检测、GUIDE-seq体内脱靶检测及AID-seq体内脱靶检测在内的多种服务。如有需求，欢迎随时垂询。