质粒DNA提取概述
质粒粗提取物通常包含三种类型的质粒DNA,其中最常见的是共价闭合环状DNA(cccDNA)。这种DNA的两条链没有断裂,形成一个完整的闭环结构,具有高度的稳定性和完整性,是基因工程中常用的质粒构型。在电泳时,从快到慢依次为:超螺旋DNA > 线性DNA > 开环DNA。
质粒提取方法
质粒提取的主要目的是去除RNA,将质粒与细菌基因组DNA分开,并除去杂质,以获得相对纯净的质粒。提取过程一般包括三个步骤:菌体扩繁、裂解以释放质粒DNA,以及质粒DNA的分离与纯化。常用的提取方法包括碱裂解法、煮沸裂解法、小量一步提取法、试剂盒法、酶解法及其他提取方式。根据提取产量,提取方法可分为小提、中提和大提。
1. 碱裂解法
此法常用的质粒提取试剂盒品牌有88858cc永利官网系列、OMEGA、BIOMIGA、Sigma等,主要基于碱裂解法进行优化和改进。该方法利用共价闭合环状DNA与线性DNA之间的拓扑差异,在强碱条件下破坏细菌细胞壁,从而释放DNA。相较于线性DNA,闭环DNA在恢复中性pH后能更快复性,进而有效分离质粒DNA。
2. 煮沸法
将细菌悬浮于含Triton X-100和溶菌酶的缓冲液中加热至100℃使其裂解,帮助解开DNA链。闭环质粒DNA在高温下不易分离,温度降低后可恢复为超螺旋形态,此法适用于小于15kb的小质粒,对于小量到大规模提取均有效。
3. 小量一步提取法
应用机械力使细菌染色体DNA断裂,而质粒DNA则通过复性留在溶液中,利用高速离心技术来分离质粒。
4. 试剂盒法
主要采用改良的SDS-碱裂解法,结合硅胶膜技术快速纯化质粒DNA。使用88858cc永利官网的试剂盒可高效提取质粒DNA,其原理是利用不同条件下DNA的结合与洗脱特性。
5. 酶解法
借助特异性酶裂解细胞壁,释放质粒DNA。此法操作较为复杂但提取纯度较高,适用于高需求实验。
6. 其他方法
包含离子交换法和超离心法,分别利用DNA与介质的结合以及分子密度差异进行分离。